• Indice Biologique Diatomées (IBD* (cours d'eau et plan d'eau), NF T90-354)
• Indice Planctonique Lacustre (IPLac, NF EN 15204) en plan d’eau
• Etude du phytoplancton en plans d’eau et cours d’eau (NF EN 15204)
• Etude des cyanobactéries (suivi de baignade, NF EN 15204)

• Indice Biologique Macrophytique en Rivières (IBMR, NF T90-395)
• Indice Biologique Macrophytique en Lacs (IBML, XP T90-328)
• Inventaire flore aquatique (espèces protégées et patrimoniales)

• Indice Biologique Global Normalisé (IBGN*, NF T90-350)
• Indice Biologique Global Adapté (IBGA, NF T90-350)
• Indice Invertébrés Multi Métriques (I2M2), selon protocole MPCE* (NF T90-333 et NF T90-388)
• Indice Invertébrés Multi Métriques Cours d’eau profonds (I2M2 cep), selon protocole MGCE* (NF T90-337 et NF T90-388)
• Indice Macroinvertébrés Lacustre (IML, Dedieu & Verneaux, 2017)
• Indice Oligochètes de Bioindication des Sédiments (IOBS, NF T90-390) et Indice Oligochètes
• Biologique Lacustre (IOBL, NF T90-393)
• Inventaires d’espèces protégées et patrimoniales (écrevisses, mollusques, …)

• Indice Poissons Rivière (IPR**, NF T90-344)
• Pêches électriques de sauvetage
• Plans d’eau : Pêche aux filets maillants (NF EN 14757)
• Etude spécifique (inventaire frayères, inventaire d’espèces protégées et patrimoniales, suivi de pollution…)

Biote - Recherche de polluants spécifiques

• Faune aquatique (poissons, crustacées, mollusques)
• Flore aquatique (bryophytes et macrophytes)

• Mesures physico-chimiques in-situ et mesures de débit
• Prélèvements d’eau et de sédiments, prélèvements intégrés, prélèvements 24h
• Analyses physico-chimiques et analyses multi-résidus
• Recherche des substances dangereuses et prioritaires, substances pertinentes, pesticides

• Protocoles cours d’eau : CARHYCE, ESTIMAB, IAM, cartographie d’habitats, …
• Protocoles plans d’eau : ALBER et CHARLI, Bathymétrie, cartographie d’habitat,…