Les tests de détection des endotoxines vérifient la sécurité, à savoir l'absence d'endotoxines, dans les produits pharmaceutiques stériles destinés à la consommation humaine. Par ailleurs, la détection des endotoxines dans les produits non stériles, ainsi que dans l'analyse de l'eau pharmaceutique, joue un rôle important.

La détection des endotoxines bactériennes, qui proviennent de bactéries à Gram négatif, est principalement effectuée à l'aide d'un lysat d'amœvocytes (LAL), obtenu à partir du sang de limule (Limulus polyphemus ou Tachypleus tridentatus). Les chapitres correspondants ont été harmonisés entre la Pharmacopée européenne ((Ph. Eur.) 2.6.14.), la Pharmacopée américaine ((USP) <85>) et la Pharmacopée japonaise ((JP) 4.01). Les endotoxines sont toxiques pour les humains et/ou les animaux et provoquent une réaction pyrogénique (augmentation de la température corporelle). Pour cette raison, il est important que les produits bio/pharmaceutiques soient testés pour leur teneur en endotoxines.